Investigação do DNA do HPV, validação in silico e papel da proteína E6 na carcinogênese colorretal
Khan, SRehman, M. UrShakeela, QAhmed, SHayat, A
O papilomavírus humano (HPV) é uma doença sexualmente transmissível prevalente. Estudos mostraram uma conexão entre o HPV e malignidades de colo do útero, pênis, vulva, vagina, ânus e orofaringe. O câncer de cólon ocupa o 10º lugar entre todos os cânceres no Paquistão, com 2,7% de incidência e 2,4% de mortalidade, enquanto o câncer retal ocupa o 16º lugar com 1,8% de incidência e 1,5% de mortalidade, de acordo com dados do Globocan 2020. A população nativa do Paquistão foi progressivamente afetada pelo câncer colorretal em apenas quatro anos. A frequência da doença em homens aumentou três vezes, de 2,3 para 6,8%, e em mulheres, de 2,5 para 6,7%. Este estudo foi baseado em 135 espécimes de biópsia embebidos em parafina coletados de vários hospitais, na divisão de Hazara, Paquistão. Predominantemente, as amostras eram adenocarcinoma do cólon, carcinoma escamoso retal e adenoma do cólon. Dez espécimes de biópsia normais foram coletados como controles. Após o processamento e tratamento com nitrogênio líquido, os espécimes foram testados usando o GeneXpert PCR para detectar DNA do HPV e genótipos de alto risco HPV16, HPV18 e HPV45. Nenhum DNA do HPV foi encontrado em nenhuma das amostras de controle. Dos 135 espécimes, 85 (62%) tiveram DNA do HPV identificado, enquanto sete espécimes foram detectados com genótipos de baixo risco HPV6, HPV11 e HPV55. No estudo in silico, o papel do E6 no desenvolvimento do câncer colorretal foi investigado por meio da análise de vias. As estruturas da proteína E6 foram recuperadas e visualizadas no MOE 2015.10. A estrutura do P16INK4A também foi recuperada do Pdb, e o encaixe foi realizado entre E6 e P16INK4A para gerar um complexo de encaixe.
Texto completo